গুরুকুল তার প্রতিষ্ঠালগ্ন থেকেই একটি সুশৃঙ্খল ও স্বচ্ছ ব্যবস্থাপনা কাঠামোর মধ্যে শিক্ষা কার্যক্রম পরিচালনা করে আসছে। শিক্ষার মান ও গুণগত মান নিশ্চিত করার স্বার্থে বর্তমানে সকল অ্যাফিলিয়েটেড (এফিলিয়েটি) ক্যাম্পাস কার্যক্রম বন্ধ ঘোষণা করা হয়েছে। শুধুমাত্র গুরুকুলের সরাসরি পরিচালিত ও তত্ত্বাবধায়ক ব্যবস্থাপনার অধীনে থাকা ক্যাম্পাসগুলোই “গুরুকুল ক্যাম্পাস” হিসেবে স্বীকৃত। এর ফলে শিক্ষার্থীরা আরও নির্ভরযোগ্য, মানসম্মত ও সমন্বিত শিক্ষা গ্রহণের সুযোগ পাচ্ছে।
ক্যাম্পাস
কুষ্টিয়া জেলা
কুষ্টিয়া সদর উপজেলা
কাঙ্গাল হরিনাথ ক্যাম্পাস – কুষ্টিয়া সদর
মীর মশাররফ হোসেন ক্যাম্পাস – কুষ্টিয়া সদর
রবি ঠাকুর ক্যাম্পাস – কুষ্টিয়া সদর
লালন সাঁই ক্যাম্পাস – কুষ্টিয়া সদর
কুমারখালি উপজেলা
বিদ্যাসাগর ক্যাম্পাস – কুমারখালি, কুষ্টিয়া
খোকসা উপজেলা
খোকসা গুরুকুল – খোকসা, কুষ্টিয়া
রাজবাড়ী জেলা
রাজবাড়ী সদর উপজেলা
কাজী নজরুল ক্যাম্পাস – রাজবাড়ী সদর
ঢাকা জেলা
ঢাকা মহানগর
ঢাকা গুরুকুল
ঠিকানা: এ–৩, নবানা সাত্তার গার্ডেন, ৮৬/১ নিউ এসকাটন রোড, ঢাকা–১০০০

গুরুকুল ক্যাম্পাসের বিশেষ বৈশিষ্ট্য:
সকল ক্যাম্পাস সরাসরি গুরুকুল ট্রাস্ট ও প্রশাসনের নিয়ন্ত্রণে পরিচালিত।
প্রতিটি ক্যাম্পাসে আধুনিক শ্রেণিকক্ষ, ল্যাবরেটরি, লাইব্রেরি ও কো-কারিকুলার কার্যক্রমের সুযোগ রয়েছে।
ক্যাম্পাসগুলোর নামকরণ করা হয়েছে বাংলা ভাষা, সাহিত্য, সংগীত ও ইতিহাসের প্রখ্যাত ব্যক্তিত্বদের নামে, যাতে শিক্ষার্থীরা তাঁদের আদর্শ ও অবদানের সাথে পরিচিত হতে পারে।